柑桔保鲜的重点是防腐烂，烂果的根源在病害，而青霉病和绿霉病是保鲜中危害最严重的两种病害，约占总烂果率的70％～90％。尤其是温州蜜柑、?柑等宽皮柑桔类发生更为普遍。
青霉病、绿霉病属于真菌性病害。都会使果实软化，产生各色绒霉，果实腐烂，发病初期两种病的症状相同，即淡褐色、圆形、病斑水渍状，病部软化较易压皱，此后迅速扩大长出白菌丝，随后中央很快长出分生孢子，从此显示两病的不同之处，分生孢子丛为青色，外缘白色菌丝圈很窄，只有1～3毫米，腐烂果不会与邻近果粘连的为青霉病；而绿霉病为绿色外缘，白色菌丝环较宽，腐烂果易与邻近果相粘连。
多年以来，各地多采用产菌灵、托布津防治柑桔青、绿霉病，浸果处理浓度为多菌灵250～1000ppm，托布津为500～1000ppm，同时加100～200ppm2，4-d，由于长期使用，近年发现托布津、多菌灵等苯并咪唑类对青、绿霉病产生抗药性。近些年来，日本研究开发的杀菌剂倍福朗防治青霉病和绿霉病，效果优于多菌灵的托布津。试验表明，用70％托布津1000倍加200ppm2，4-d浸果，贮藏100天防病效果只有7.8％～53.6％；而使用25％倍福朗水剂2000～3000倍浸果，防病效果达到82.5％～88.7％，贮藏100天，好果率达90％以上，而且果实鲜艳度明显超过常规药剂。
抑霉唑对控制柑桔青霉病、绿霉病孢子形成方面的效力，比托布津等常用杀菌剂更大，而且能抑制对托布津等类药剂具有抗药性的青、绿霉菌系，但对其他致病病菌无效。采后浸果处理的浓度为1000ppm，在蜡处理中可使用2000～3000ppm的浓度，对防治青、绿霉病有特效。据报道：用中草药苦良姜、野艾叶、野菊花8％溶液洗果，对抑制这两病菌也有显著的效果。苯米特亦被广泛用于控制青、绿霉病和蒂腐病，常用剂型是50％可湿性粉剂，浸果使用浓度是250～1000ppm。
在贮藏过程中，发现有青、绿霉病的要及时捡出，并且病果附近的果要用1000ppm托布津浸洗，污染的箱壁也要用托布津清洗干净。
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