柑桔黄斑病在广东各地都有发生。主要为害叶片。有时也侵害果实和小枝。
发病初期叶片背面病斑上出现针头大小的褪绿小点，对光透视呈半透明状，并在叶背面病斑上出现疱疹状淡黄色突起小粒点，几个乃至数十个群生在一起，随着病斑的扩展和老化，小粒点颜色加深，变成暗褐色至黑褐色的脂斑，与脂斑相对应的叶的正面上，形成不规则的黄色病斑，边缘不明显，中部有淡褐色至黑褐色的疱疹状小粒点。病斑在病叶上分布不规则，常有很多病斑集中在病叶中脉的一侧，而另一侧则无病斑，叶片发病后常引起大量落叶，对树势和产量影响很大。
除了上述症状外，有时候叶片表面出现赤褐色芝麻大小的近圆形斑点，后稍扩大，变成圆形或椭圆形灰褐色病斑，直径约0.1－0.3厘米，边缘颜色深且稍隆起，中间颜色淡，稍凹陷，后期呈灰白色，在上面长有黑色小粒点。
上述两种症状均为柑桔黄斑病的症状，但由于病菌的侵染期不同和寄主的老熟程度不同而稍有差异。如寄主在展叶后不久感病，则病斑呈黄斑型，若病菌在叶片老熟后侵染，则病斑表现为褐色小圆斑型。病菌侵染的季节不同，病斑类型也稍有差异。如在春梢及夏梢侵染，病斑以黄斑型居多。若在秋季侵染则两种症状类型都有发生。
果实受侵害后，在果皮上出现红褐色小斑点，病菌一般不侵入果肉。
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