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果用银杏在9月份当外种皮呈橙黄色或自然脱落时即可采集。为便于收集应事先割除树冠下的杂草灌丛，再用竹竿击落。种子采回后，铺在地上，覆盖稻草或直接置于阴凉处摊放4―5天，待外种皮腐烂，淘洗干净，晒干后用麻袋或竹篓装好，置干燥处存放以防虫蛀。
叶用银杏在生长季节以留叶为主，分期分批采摘短枝上33％的叶片。先摘除树冠内和下部枝条上的老叶，待10月中、下旬叶片发黄即将落叶时大批采收，此期叶内所含类黄酮物质最多，对树体养分积累影响不大。采叶方法以手摘为好，切忌用木棍敲打，以免损伤树体，影响来年产量。采叶后若天气晴朗可将鲜叶在地面上摊晒，经常翻动，晒干；如遇雨天可以火炕烘干，置干燥室内存放。
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