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芹菜的苗期较长，当5—6片真叶以后，逐渐加速生长。当营养生长盛期时，需肥也进入了旺盛期。芹菜生长所需的主要营养为氮、磷、钾、钙、镁五要素，比例大致为9.1：1.3：5：7：1。
一、肥水管理。为了培育壮苗，当幼苗在2—3片真叶时，可以少量追施一次提苗肥，这次提苗肥以每亩5公斤尿素与5公斤硫酸钾复合肥混合冲施为宜。当芹菜5—6片真叶，苗龄50—60天时即可定植。芹菜需肥量较大，应提倡重施基肥。可每亩施用腐熟好的优质圈肥2500—5000公斤，氮、磷、钾三元复合肥25—50公斤，硼、锌肥各1公斤。有条件的可以施用生物有机肥和腐殖酸类肥料，每亩以50—100公斤为宜。芹菜定植以后，追肥上应把握以促为主的原则。缓苗肥每亩冲施尿素10公斤即可。当6片真叶以后，把握好10天左右一次，以水带肥冲施，先少后多，逐步加大追肥量，以尿素和硫酸钾肥为主，注意夏秋季芹菜不宜冲施人粪尿和畜禽粪肥，易引起烂根。每亩每次冲施尿素和硫酸钾复合肥各5公斤，收获前15天追施最后一次肥料，以每亩冲施尿素15公斤为宜。
以上追肥数量可以满足芹菜生长发育的需要，达到优质高产，一般亩产可以在7500公斤左右。
二、病虫害防治。为防止芹菜苗期土传病害，防止死苗，苗床土消毒很重要，用68%的金雷水分散粒剂（精甲霜灵与代森锰锌复配）每平方米8—10克，混干细土15公斤，采取下铺上盖方法，即1/3药土铺在畦面上，2/3药土覆盖在种子上，可以有效防治苗期猝倒病、立枯病等。
芹菜秋季易发生斑枯病和叶枯病，适用药剂有多菌灵、百菌清、甲基硫菌灵。如采用移栽后喷施1次阿米西达（嘧菌酯）1500倍液，当植株进入生长盛期时再喷施一次，可以防治各类真菌性病害，减少用药量，并能使芹菜生长健壮、增产，效果非常理想。
芹菜的假黑斑病，可以采用75%的达克宁（百菌清）600倍；10%的世高水分散粒剂1500倍或64%的杀毒矾可湿性粉剂500倍喷雾防治，每7—10天一次，连续防治2—3次。
芹菜菌核病，用50%速可灵或50%的农利灵1000倍；对以上药剂产生抗药性的，可用50%的和瑞（嘧菌环胺）水分散粒剂1500倍喷雾防治，一般7天一次，连续防治2次。
蚜虫是芹菜的主要虫害，可用10%的吡虫啉1500倍；或25%的阿克泰水分散粒剂5000倍喷雾防治，能兼治白粉虱和蓟马、潜叶蝇等害虫，并通过杀灭害虫，有效地预防芹菜软腐病和病毒病的发生。