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洋葱是喜肥作物，对营养元素的吸收以钾为最多，氮、磷、硼次之，其中氮对洋葱生育影响最大。
洋葱施肥可分为两大部分，即基肥和追肥。在洋葱生产过程中，施肥的原则是分期、多次、营养元素平衡施肥（微量元素要重视如硼元素）。
一、基肥
苗床：氮、磷、钾、持力硼做底肥1次施用。大田：可将定植后洋葱所需氮肥的1/3作为大田基肥的施用量，其余2/3作为追肥；磷肥可将2/3作为墓肥， 1/3作为追肥；钾肥可全部作底肥；微量元素持力硼每亩1次施入200克。
二、追肥
洋葱秧苗不能过大，以免先期抽薹，因此基肥充足，育苗期一般不追肥。如果幼苗生长很细弱，可结合浇水，每亩追施尿素3公斤左右，促进幼苗生长，以增强越冬能力。
洋葱定植后，要分期适量追肥。返青后，结合浇水追施1次肥，促进叶片生长，一般每亩施腐熟稀粪尿肥800～1000公斤，磷钾不足的田块要施用过磷酸钙和草木灰。发棵肥：一般每亩施腐熟稀粪尿肥800～1000公斤或者每亩施入尿素10克。催头肥：鳞茎膨大期，是施肥的关键时期，要追肥1～2次，一般每亩可施腐熟稀粪肥1000公斤左右或尿素约15公斤，第二次看土壤肥力和洋葱生长状况而定。
微量元素硼的作用不可忽视，洋葱缺硼：新叶失绿畸形，质地变脆；叶鞘部分发生梯形裂纹；鳞茎疏松，严重时发生心腐病。缺硼地区补硼后增产、提高品质，效果明显，但补硼要选择优质硼肥，目前市场上有美国进口的持力硼、速乐硼，补硼效果很好，很受农民的欢迎。
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