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方法一：针对疫霉根腐病发生较严重的棚室，可穴施乙磷铝混加DT各1克进行预防；针对茎腐病发生较严重的棚室，可穴施甲基立枯磷混加DT各1克进行预防。
甜椒定植缓苗后，可灌施上述药剂混加生根壮苗剂1500倍，7-10天灌一次，连续灌根2-3次，巩固防病效果，促进生根，避免地上部生长过旺而根系生长差的情况发生。
方法二：利用菌肥以菌抑菌的作用，可穴施或沟施激抗菌968生物菌肥预防根部病害，亩用量80-120公斤即可，同时，菌在不断繁殖过程中还能产生刺激根系生长的物质，促进根系生长、抑制地上部旺长。一药多用，效果显著。
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